カラーボックス軸 (cb-軸) が splot で自動縮尺されている場合は、その カラーボックスの範囲は zrange が使われます。splot ... pm3d| palette で描画される点は、異なる zrange と cbrange を使うことでフィルタリ ングできます。
set cbrange の書式に関する詳細は set xrange を参照してください。 set palette と set colorbox も参照してください。